Я работал со сценарием, который использует metaMS и xcms для просмотра файлов CDF GCMS. Я полагаю, сценарий в порядке, потому что я буквально только изменил файл базы данных до того, как он начал выдавать ошибки.
С тех пор я изменил файл базы данных на то, что было раньше, попробовал более ранние итерации сценария, переустановил R и R studio и впоследствии переустановил BiocManager для переустановки metaMS и xcms, но безрезультатно.
У него особые проблемы с MSnbase и rtools, говоря, что мне нужны rtools для установки пакетов, но этот rtools несовместим с моей версией R (я использую R 3.6 и R Studio 1.2.1335 - я открыт для обновления, но это часто вызывает проблемы с некоторыми пакетами, поэтому я пытаюсь этого избежать).
Я даже пытался запустить от имени администратора для переустановки, но он все еще не работает.
I Я включаю изображения различных ошибок, с которыми я столкнулся.
Если у вас есть ЛЮБЫЕ идеи, я открыт для них. Я в полной растерянности.
PS Обязательно устанавливаю зависимости. Я пробовал установить через командную строку и через установщик.
