Исправлено. Для тех, кто задается вопросом, почему это не работает, попробуйте добавить selectAll в свой код.
var line_fatality = svg
.selectAll("dot")
.append('g')
.classed('fatality',true)
.data(check[0].values)
.enter()
.append("circle")
.attr('cx', (function (d, i) {
return x(d.date)
}))
.attr('cy', (function (d, i) { return y(d.fatality) }))
.attr("r", 1.5)
.style("fill", "#69b3a2")
Обновлен SVG