У меня есть файл кровати с именем cover.bed. Когда я выполняю head coverage.bed, это начало того, что выводит:
chr start end . . strand length CG CA CT CC TG AG GG
chr1 3000380 3000440 . . + 172 0 2 9 2
chr1 3000492 3000552 . . + 172 0 1 9 1
chr1 3000593 3000653 . . + 1055 0 4 7 4
Однако, когда я просматриваю файл, используя gedit coverage.bed, я вижу, что это правильные первые 3 строки:
chr start end . . strand length CG CA CT CC TG AG GG
chr1 3000380 3000440 . . + 172 0 2 9 1 3 5 2
chr1 3000492 3000552 . . + 172 0 1 9 2 8 1 1
chr1 3000593 3000653 . . + 1055 0 4 7 3 6 5 4
Почему это происходит? Сценарий python вывел этот файл - возможно ли, что что-то не так с кодом, которое привело бы к этой ошибке?
Изменить: результат sed -n 2p coverage.bed | hexdump -C:
00000000 63 68 72 31 09 33 30 30 30 33 38 30 09 33 30 30 |chr1.3000380.300|
00000010 30 34 34 30 09 2e 09 2e 09 2b 09 31 37 32 09 30 |0440.....+.172.0|
00000020 09 32 09 39 09 31 09 33 09 35 09 32 0d 0a |.2.9.1.3.5.2..|
0000002e