Run выполняет поиск вашего файла в папках глобальной переменной %PATH%. Маловероятно, что ваш сценарий находится в одном из каталогов, упомянутых в %PATH%.
Чтобы увидеть содержимое PATH, введите ECHO %PATH% в командную строку. Затем вы можете переместить свой сценарий в один из каталогов.
В качестве альтернативы, чтобы временно (для текущего сеанса CMD) добавить каталог в PATH, запустите SET PATH=%PATH%;C:\path в командной строке. Постоянное изменение PATH требует использования реестра.
Я рекомендую вам пересмотреть этот подход, поскольку запуск CMD с последующим переходом к местоположению сценария (CD C:\path) для последующего запуска сценария обычно предпочтительнее, чем изменение глобального переменные.