Выполняете ли вы рекурсивный поиск на hdfs с помощью приведенной ниже команды, в которой вы написали файл с output/part-r-00000
hadoop fs -ls -R /user/your_directory grep -i "output/part-r-00000"
, должны рекурсивно перечислять каталоги.
Настройте свой код или сценарий, чтобы указать к этому.