Сбой компиляции пакета r move. Возможное неправильное расположение файла - PullRequest
Новая
       11

Сбой компиляции пакета r move. Возможное неправильное расположение файла

0 голосов
/ 18 июня 2020

Я пытаюсь обновить пакет перемещения в R. Он должен быть скомпилирован из исходников. Сбой компиляции. Я скопировал несколько сообщений об ошибках ниже. Но мне интересно, может ли это быть связано с проблемой на моей ma c (с Catalina) с местоположением g cc. Когда я набираю which gcc, он возвращает /usr/bin/gcc, но когда я набираю gcc --version, я получаю 

Configured with: --prefix=/Applications/Xcode.app/Contents/Developer/usr --with-gxx-include-dir=/Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Platforms/MacOSX.platform/Developer/SDKs/MacOSX.sdk/usr/include/c++/4.2.1
Apple clang version 11.0.3 (clang-1103.0.32.62)
Target: x86_64-apple-darwin19.5.0
Thread model: posix
InstalledDir: /Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Toolchains/XcodeDefault.xctoolchain/usr/bin

Обратите внимание, что сообщения об ошибках указывают на версию Applications.Xcode.app v1 ... но configure with path не включает v1.

Начало сообщений об ошибках при компиляции 

clang -mmacosx-version-min=10.13 -I"/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include" -DNDEBUG  -I'/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/library/Rcpp/include' -I/usr/local/include   -fPIC  -Wall -g -O2  -c bgbVar.c -o bgbVar.o
clang++ -mmacosx-version-min=10.13 -std=gnu++11 -I"/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include" -DNDEBUG  -I'/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/library/Rcpp/include' -I/usr/local/include   -fPIC  -Wall -g -O2  -c bgbVarRcpp.cpp -o bgbVarRcpp.o
clang -mmacosx-version-min=10.13 -I"/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include" -DNDEBUG  -I'/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/library/Rcpp/include' -I/usr/local/include   -fPIC  -Wall -g -O2  -c bgb_bbmm.c -o bgb_bbmm.o
clang++ -mmacosx-version-min=10.13 -std=gnu++11 -I"/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include" -DNDEBUG  -I'/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/library/Rcpp/include' -I/usr/local/include   -fPIC  -Wall -g -O2  -c emd.cpp -o emd.o
In file included from emd.cpp:1:
In file included from /Library/Frameworks/R.framework/Resources/include/R.h:50:
In file included from /Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Toolchains/XcodeDefault.xctoolchain/usr/bin/../include/c++/v1/cmath:304:
/Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Toolchains/XcodeDefault.xctoolchain/usr/include/c++/v1/math.h:760:41: error: no member named 'fabsf' in the global namespace; did you mean 'labs'?
abs(float __lcpp_x) _NOEXCEPT {return ::fabsf(__lcpp_x);}
                                      ~~^
/Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Platforms/MacOSX.platform/Developer/SDKs/MacOSX.sdk/usr/include/stdlib.h:148:7: note: 'labs' declared here
long     labs(long) __pure2;
...