Это очень странная проблема. Давайте начнем с этого очень простого примера:
## ... some other code ...
chartSeries(y, theme='white',style="candlesticks", subset='last 12 months')
names(y) <- c("Open", "High", "Low", "Close", "Volume")
addEMA(n=3, col='red')
addEMA(n=10,col='green')
addEMA(n = 18, col = 'blue')
## ... other code ...
Если файл в том виде, в каком он есть, использует "source filename.R" et c, диаграмма выскочила, но эти линии addEMA не были нанесены. Однако эти строки addEMA () будут работать при ручном запуске, выделив строки addEMA и запустив выбранные строки.
И Linux, и Windows видят эту проблему.