Думаю, вы неправильно понимаете, что делает react-native link
. react-native link
- это автоматический c способ установки собственных зависимостей. подробнее здесь
В случае Native Base. Эта библиотека состоит из других npm пакетов, поэтому вам необходимо установить их для правильной работы с Native Base.
Native Base Docs состояния
Install Peer Dependencies Peer зависимости, включенные в какие-либо пакеты npm, не устанавливаются автоматически. Ваше приложение не будет зависеть от этого явно. подробнее здесь