Из вашего сообщения не ясно, какой шаблон используется в определении вашей сборки (по умолчанию, обновление или управление лабораторией). Если я правильно понимаю, вы хотели бы легко настроить определение сборки, которое строит то же решение, но из другой ветви.
Одна вещь, которую вы можете попробовать вместо копирования определения, это отредактировать его. Когда ветвь умирает, переименуйте определение сборки (может помочь с отчетностью), измените отображение рабочей области сборки, и все будет готово.
Спасибо, Ладислау