Начать R напрямую из CMD
.libPaths() возвращает как system , так и R_LIBS_USER пути
Запуск R из CMD после cd в рабочий каталог
.libPaths() возвращает только системные пути. Кроме того, path.expand("~") изменился
Я поставил тот же .Renviron в новый path.expand("~"). Не работает.