Как красиво аннотировать ggplot2 (руководство)

Question

Использование ggplot2 Обычно я использую geom_text и что-то вроде position=jitter, чтобы комментировать свои графики.

Однако - для хорошего сюжета я часто считаю целесообразным аннотировать вручную. как ниже:

data2 <- structure(list(type = structure(c(5L, 1L, 2L, 4L, 3L, 5L, 1L, 
2L, 4L, 3L, 5L, 1L, 2L, 4L, 3L, 5L, 1L, 2L, 4L, 3L), .Label = c("EDS", 
"KIU", "LAK", "MVH", "NA*"), class = "factor"), value = c(0.9, 
0.01, 0.01, 0.09, 0, 0.8, 0.05, 0, 0.15, 0, 0.41, 0.04, 0.03, 
0.52, 0, 0.23, 0.11, 0.02, 0.64, 0.01), time = c(3L, 3L, 3L, 
3L, 3L, 6L, 6L, 6L, 6L, 6L, 15L, 15L, 15L, 15L, 15L, 27L, 27L, 
27L, 27L, 27L), year = c(2008L, 2008L, 2008L, 2008L, 2008L, 2007L, 
2007L, 2007L, 2007L, 2007L, 2007L, 2007L, 2007L, 2007L, 2007L, 
2006L, 2006L, 2006L, 2006L, 2006L)), .Names = c("type", "value", 
"time", "year"), row.names = c(1L, 3L, 4L, 5L, 6L, 7L, 9L, 10L, 
11L, 12L, 13L, 15L, 16L, 17L, 18L, 19L, 21L, 22L, 23L, 24L), class = "data.frame")
ggplot(data2, aes(x=time, y=value, group=type, col=type))+
geom_line()+
geom_point()+
theme_bw()+
annotate("text", x=6, y=0.9, label="this is a wrong color")+
annotate("text", x=15, y=0.6, label="this is a second annotation with a wrong color")

Проблема в том, что я не могу получить цвет текстовых аннотаций, соответствующий цвету линии. Я полагаю, я мог бы исправить это с помощью ручного масштаба, но я надеюсь, что есть лучший способ?

Answer 1

У меня была похожая проблема, и я решил ее с помощью JD Long answer. Но в результате обновления ggplot2 до версии 0.9.0 я заметил, что все вызовы geom_text() оказываются несколько размытыми на графиках.

Благодаря Кохске Я обнаружил, что этот код

ggplot(data2, aes(x=time, y=value, group=type, col=type))+
geom_line()+
geom_point()+
theme_bw() +
geom_text(aes(7, .9, label="correct color", color="NA*")) +
geom_text(aes(15, .6, label="another correct color!", color="MVH")) 

отображает geom_text nrow(data2) раз!

Правильный способ предоставления данных в geom_text - это создание другого data.frame, содержащего координаты, метки и цвета для строк, которые вы хотите построить:

data2.labels <- data.frame(
  time = c(7, 15), 
  value = c(.9, .6), 
  label = c("correct color", "another correct color!"), 
  type = c("NA*", "MVH")
  )

ggplot(data2, aes(x=time, y=value, group=type, col=type))+
  geom_line()+
  geom_point()+
  theme_bw() +
  geom_text(data = data2.labels, aes(x = time, y = value, label = label))

Answer 2

Если вы используете geom_text () вместо annotate (), вы можете передать групповой цвет на свой график:

ggplot(data2, aes(x=time, y=value, group=type, col=type))+
geom_line()+
geom_point()+
theme_bw() +
geom_text(aes(7, .9, label="correct color", color="NA*")) +
geom_text(aes(15, .6, label="another correct color!", color="MVH")) 

Итак, используя annotate (), это выглядит так: альтернативный текст http://www.cerebralmastication.com/wp-content/uploads/2010/03/before.png

тогда после использования geom_text () это выглядит так: альтернативный текст http://www.cerebralmastication.com/wp-content/uploads/2010/03/after.png