Я думаю, вы случайно добавили node_modules в свою ветку.
Чтобы удалить его из PR ->
Вам нужно сначала удалить эту папку node_modules, а затем зафиксировать это и пу sh это удаленно. Вот и все.
После принятия изменений вы должны переустановить node_modules, поскольку мы их удалили. На этот раз это не будет отслеживаться.
Обычно node_modules не отслеживаются с помощью файла .gitignore, но есть способы сделать это sh случайно.