Как ранжировать ген, используя информацию получения?

Question

как проводится ранжирование генов для данных микрочипов с использованием статистических данных и статистики хи-квадрат? Пожалуйста, проиллюстрируйте это простым примером.

Answer 1

Вы можете использовать программное обеспечение с открытым исходным кодом для машинного обучения Weka . Загрузите ваш набор данных и перейдите на вкладку «Выбор атрибута». Используйте следующие атрибуты оценки:

ChiSquaredAttributeEval : Оценивает ценность атрибута путем вычисления значения статистики хи-квадрат по отношению к классу.

InfoGainAttributeEval : Оценивает ценность атрибута путем измерения прироста информации относительно класса.

.. используя Ranker в «Методе поиска». Таким образом, атрибуты ранжируются по их индивидуальным оценкам

Answer 2

вы можете использовать InfoGainAttributeEval для расчета прироста информации и для получения дополнительной информации проверить этот ответ

Answer 3

Я не совсем понимаю ваш вопрос, но очень удачный пакет для анализа данных микрочипов можно найти здесь:

Bioconductor

Это программный проект, который имеет множество различных модулей для считывания данных с микрочипов и выполнения статистического анализа. Это очень полезно, потому что форматы файлов для данных микрочипов постоянно меняются по мере развития технологии, и алгоритмы анализа данных микрочипов также значительно продвинулись.