Вы можете запускать .py файлы в Pycharm, но вы не можете запускать тот же файл из CLI?
Вероятно, это связано с тем, что один из модулей, которые вы пытаетесь импортировать, не установлен в вашей среде. Я бы порекомендовал установить инструмент управления средой, такой как anaconda (https://www.anaconda.com/products/individual). Затем создайте новую среду, активируйте ее и запустите:
pip install Something