Найдите pixel_maxima на изображении, а также его координаты, а также максимальную интенсивность - PullRequest
0 голосов
/ 06 августа 2020

У меня есть это входное изображение, и я хочу найти максимумы пикселей, и оно должно выглядеть как image2. Я пробовал рисовать контуры, но он не работает. Я также попробовал scipy pixel_maxima, он не дает мне результата как image2. вот код, я сослался на этот ответ ( Получить координаты локальных максимумов в 2D-массиве выше определенного значения )

import numpy as np
import scipy.misc
import scipy.ndimage as ndimage
import scipy.ndimage.filters as filters
import matplotlib.pyplot as plt
import imageio
from skimage.color import rgb2gray

fname = 'slice-0001-trim.jpg'
neighborhood_size = 10
threshold = 12


data = imageio.imread(fname,as_gray=True)

data_max = filters.maximum_filter(data, neighborhood_size)
maxima = (data == data_max)
data_min = filters.minimum_filter(data, neighborhood_size)
diff = ((data_max - data_min) > threshold)
maxima[diff == 0] = 0

labeled, num_objects = ndimage.label(maxima)
slices = ndimage.find_objects(labeled)
x, y = [], []
for dy,dx in slices:
    x_center = (dx.start + dx.stop - 1)/2
    x.append(x_center)
    y_center = (dy.start + dy.stop - 1)/2    
    y.append(y_center)

plt.imshow(data)
plt.savefig('sample.jpg', bbox_inches = 'tight')

plt.autoscale(False)
plt.plot(x,y, 'ro')
plt.savefig('result.png', bbox_inches = 'tight')

Image_1

I need this image as result

Image_2

But, I get this image as output введите описание изображения здесь

...