Не зная, каковы ограничения вашего проекта, я не уверен, требуется ли отслеживание кликов отдельно от содержимого Flash. По моему опыту большая часть отслеживания кликов по баннерам обрабатывается в содержимом Flash. Таким образом, большинство агентств, производящих баннеры, будут иметь Flash-шаблон для баннеров, который включает в себя весь код отчета о кликах, или Flash-упаковщик, который загружает в него баннеры и отслеживает клики.
swfobject, насколько я знаю, просто используется для последовательного отображения Flash во всех браузерах, нет возможности использовать swfobject в качестве устройства отслеживания кликов.
Возможно, вы сможете реализовать решение javascript, обернув swfobject, встроенный в другую оболочку javascript, которая может отслеживать клики за вас. Преимущество использования флэш-памяти заключается в том, что вы можете отслеживать, где пользователь нажимал или даже где он завис над объектами и как долго.