Я нашел способ сделать это программно. Нет необходимости использовать настраиваемые возможности REST API ScriptRunner, как описано здесь
Получите доступ к вызову ниже GET с необходимыми параметрами запроса,
https://{YOUR_JIRA_HOME_URL}/XrayRequirementProjectsConfiguration.jspa?makeCompatible={PROJECT_KEY}
Укажите ключ проекта, для которого вы хотите включить покрытие XRAY.