Да, вы можете использовать каналы методов для вызова методов c, специфичных для платформы, из flutter.
У меня была похожая ситуация, когда мне приходилось использовать paytabs SDK для iOS и Android. Я использовал каналы методов для передачи параметров SDK на платформах. На самом деле он работает очень хорошо.
Я не знаю об ATOM, но вы можете взглянуть на SDK, который я сделал для flutter здесь . Это просто рабочий пример для начала.