Если у вас есть контроль над созданием файла, лучше представлять ноль без значения. Например, ina | файл с разделителями, записи могут выглядеть так:
тест || 1 | test2 ||||
две трубы рядом друг с другом обозначают как ноль.
Если у вас нет контроля над форматом файла, вероятно, проблема в том, что слово null не попадет непосредственно в таблицу, где тип данных является числовым типом, например, int. В этом случае вы можете создать свой собственный пакет служб SSIS и использовать производный столбец для правильного размещения столбца или вставить данные в промежуточную таблицу, где все столбцы определены как varchar или nvarchar, с помощью мастера, а затем использовать t-sql для очистки и перенести данные в рабочую таблицу.