Я не могу понять, зачем вам это нужно, но вот:
Для 3:
>>> [[int(x) for x in "{0:03b}".format(y)] for y in range(8)]
[[0, 0, 0], [0, 0, 1], [0, 1, 0], [0, 1, 1], [1, 0, 0], [1, 0, 1], [1, 1, 0], [1, 1, 1]]
>>>
Для 5:
>>> [[int(x) for x in "{0:05b}".format(y)] for y in range(32)]
[[0, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 0, 1], [0, 0, 0, 1, 0], [0, 0, 0, 1, 1], [0, 0, 1, 0, 0], [0, 0, 1, 0, 1], [0, 0, 1, 1, 0], [0, 0, 1, 1, 1], [0, 1, 0, 0, 0], [0, 1, 0, 0, 1], [0, 1, 0, 1, 0], [0, 1, 0, 1, 1], [0, 1, 1, 0, 0], [0, 1, 1, 0, 1], [0, 1, 1, 1, 0], [0, 1, 1, 1, 1], [1, 0, 0, 0, 0], [1, 0, 0, 0, 1], [1, 0, 0, 1, 0], [1, 0, 0, 1, 1], [1, 0, 1, 0, 0], [1, 0, 1, 0, 1], [1, 0, 1, 1, 0], [1, 0, 1, 1, 1], [1, 1, 0, 0, 0], [1, 1, 0, 0, 1], [1, 1, 0, 1, 0], [1, 1, 0, 1, 1], [1, 1, 1, 0, 0], [1, 1, 1, 0, 1], [1, 1, 1, 1, 0], [1, 1, 1, 1, 1]]
>>>
Соответствие вашему форматирование сложнее.