Когда вы говорите «С другим apache», вы имеете в виду другую версию? Почему вы не можете использовать одну и ту же версию для обоих приложений? Возможно, вам нужен просто другой экземпляр приложения вместо нового экземпляра apache.
В любом случае, как сказал Дэвид в комментариях, вы должны проверить docker. Это самый простой способ сделать это.
Если это слишком много, у вас есть вики-страница, где настраивается несколько экземпляров apache. Надеюсь, это будет полезно.
Запуск нескольких apache экземпляров