Объекты Jython не будут хорошо работать с системой сериализации javas, и с самоанализом раньше возникали серьезные проблемы. Я еще не проверял проблемы самоанализа в последних выпусках jython, так что это может быть устаревшей проблемой. Но кроме этих незначительных вещей, по моему опыту, все остальное работает хорошо.