Если вы пытаетесь получить только ссылки, тогда нет необходимости в двоичном режиме, также поскольку вы импортировали pandas, вы можете использовать это для их сохранения.
Сначала создать фрейм данных:
df = pd.DataFrame([a['href'] for a in excel_sheets if filetype in a['href']])
Затем просто сохраните его без имен столбцов (header = False):
df.to_csv('All_Links_2.csv', header=False)