Сгенерировать родословную для растений в R - PullRequest
1 голос
/ 13 июля 2020

До сих пор я использовал библиотеку synbreed для создания родословной моих растений. С помощью этого кода: PED <-create.pedigree (dataF $ GENOTYPE, dataF $ MOTHER, dataF $ FATHER, add.ancestors = TRUE))

Но в версии 4 R я не могу установить библиотеку synbreed, поэтому попробуйте попробовать библиотеку kinship2, но я всегда получаю сообщение об ошибке, так как у меня нет информации о сексе, потому что они растения. Кто-нибудь может дать мне рекомендацию, какой бы она ни была, большое вам спасибо.

1 Ответ

0 голосов
/ 14 июля 2020

Глядя на документацию kinship2, похоже, что вы можете передать 'unknown' в качестве аргумента пола:

sex Пол человека указан в id. Либо символьные («мужской», «женский», «неизвестный», «завершенный»), либо числовые c (1 = «мужской», 2 = «женский», 3 = «неизвестный», 4 = «завершенный») данные позволено. Для символьных данных строка может быть усечена в произвольном регистре.

( Source .)

Я не знаком с этими пакетами, поэтому может быть совершенно не в базе.

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...