Вы можете обработать ресурс в файл заголовка с байтовым массивом, если он не слишком большой:
char TOP_SECRET[] = {
84, 111, 112, 32, 115, 101,
…
};
И вы можете зашифровать или запутать ресурс, будь то в отдельном файле или в двоичном файле, чтобы было сложнее найти в двоичном файле известный заголовок или магическую последовательность. Простой XOR подойдет для большинства целей.