Как преобразовать большой XML файл в Pandas DataFrame? - PullRequest
Новая
       92

Как преобразовать большой XML файл в Pandas DataFrame?

0 голосов
/ 06 августа 2020

Я создал следующую функцию, которая преобразует файл XML в DataFrame. Эта функция хорошо работает для файлов размером менее 1 ГБ, для всего, что превышает этот размер ОЗУ (13 ГБ ОЗУ Google Colab) дает сбой. То же самое произойдет, если я попробую локально на ноутбуке Jupyter (4 ГБ ОЗУ для ноутбука). Есть ли способ оптимизировать код?

Код 

#Libraries
import pandas as pd
import xml.etree.cElementTree as ET

#Function to convert XML file to Pandas Dataframe    
def xml2df(file_path):

  #Parsing XML File and obtaining root
  tree = ET.parse(file_path)
  root = tree.getroot()

  dict_list = []

  for _, elem in ET.iterparse(file_path, events=("end",)):
      if elem.tag == "row":
        dict_list.append(elem.attrib)      # PARSE ALL ATTRIBUTES
        elem.clear()

  df = pd.DataFrame(dict_list)
  return df

Часть файла XML ('Badges. xml') 

<badges>
  <row Id="82946" UserId="3718" Name="Teacher" Date="2008-09-15T08:55:03.923" Class="3" TagBased="False" />
  <row Id="82947" UserId="994" Name="Teacher" Date="2008-09-15T08:55:03.957" Class="3" TagBased="False" />
  <row Id="82949" UserId="3893" Name="Teacher" Date="2008-09-15T08:55:03.957" Class="3" TagBased="False" />
  <row Id="82950" UserId="4591" Name="Teacher" Date="2008-09-15T08:55:03.957" Class="3" TagBased="False" />
  <row Id="82951" UserId="5196" Name="Teacher" Date="2008-09-15T08:55:03.957" Class="3" TagBased="False" />
  <row Id="82952" UserId="2635" Name="Teacher" Date="2008-09-15T08:55:03.957" Class="3" TagBased="False" />
  <row Id="82953" UserId="1113" Name="Teacher" Date="2008-09-15T08:55:03.957" Class="3" TagBased="False" />
...