Не ответ, просто совет, но слишком длинный, чтобы уместиться в качестве комментария:
Вместо того, чтобы выгружать только стандартный вывод, вы можете выгрузить также другую полезную информацию:
$process = new Process(['/usr/bin/python', '/my/full/path/test.py', 'helloworld']);
$process->run();
echo "Output:\n";
dump($process->getOutput());
echo "Error:\n";
dump($process->getErrorOutput());
echo "Exit code: " . $process->getExitCode() . "\n";
die;