Что вы хотите сделать, так это использовать python для выполнения команды bash (при условии, что вы используете linux), вы должны использовать ту же команду для запуска файла java, который равен java main
где main
равно main.class
вот простой скрипт, который использует subprocess
для запуска команды
import subprocess
cmd = 'java main'.split(' ')
subprocess.run(cmd)