подавить вывод на печать объект sf - PullRequest
Новая
       123

подавить вывод на печать объект sf

1 голос
/ 14 июля 2020

Я пытаюсь сохранить в списке эквивалент head объекта sf. Когда вы используете head в классе sf, он выводит на консоль немного вводящую в заблуждение информацию о периметре данных, см. bbox информация отличается от оригинала: 

library(sf)
library(tidyverse)
nc <- st_read(system.file("shape/nc.shp", package = "sf"))
# Simple feature collection with 100 features and 14 fields
# geometry type:  MULTIPOLYGON
# dimension:      XY
# bbox:           xmin: -84.32385 ymin: 33.88199 xmax: -75.45698 ymax: 36.58965
# geographic CRS: NAD27


head(nc)
# Simple feature collection with 6 features and 14 fields
# geometry type:  MULTIPOLYGON
# dimension:      XY
# bbox:           xmin: -81.74107 ymin: 36.07282 xmax: -75.77316 ymax: 36.58965
# geographic CRS: NAD27
#    AREA PERIMETER CNTY_ CNTY_ID        NAME  FIPS FIPSNO CRESS_ID BIR74 SID74 NWBIR74 BIR79 SID79 NWBIR79                       geometry
# 1 0.114     1.442  1825    1825        Ashe 37009  37009        5  1091     1      10  1364     0      19 MULTIPOLYGON (((-81.47276 3...
# 2 0.061     1.231  1827    1827   Alleghany 37005  37005        3   487     0      10   542     3      12 MULTIPOLYGON (((-81.23989 3...
# 3 0.143     1.630  1828    1828       Surry 37171  37171       86  3188     5     208  3616     6     260 MULTIPOLYGON (((-80.45634 3...
# 4 0.070     2.968  1831    1831   Currituck 37053  37053       27   508     1     123   830     2     145 MULTIPOLYGON (((-76.00897 3...
# 5 0.153     2.206  1832    1832 Northampton 37131  37131       66  1421     9    1066  1606     3    1197 MULTIPOLYGON (((-77.21767 3...
# 6 0.097     1.670  1833    1833    Hertford 37091  37091       46  1452     7     954  1838     5    1237 MULTIPOLYGON (((-76.74506 3...

Это потому, что я думаю, он вычисляет bbox для первых 6 наблюдений, а не для всего фрейма данных. В качестве альтернативы вы можете запустить следующий print (см. bbox то же самое для полного набора данных): 

print(nc, n = getOption("sf_max_print", default = 6))
# Simple feature collection with 100 features and 14 fields
# geometry type:  MULTIPOLYGON
# dimension:      XY
# bbox:           xmin: -84.32385 ymin: 33.88199 xmax: -75.45698 ymax: 36.58965
# geographic CRS: NAD27
# First 6 features:
#    AREA PERIMETER CNTY_ CNTY_ID        NAME  FIPS FIPSNO CRESS_ID BIR74 SID74 NWBIR74 BIR79 SID79 NWBIR79                       geometry
# 1 0.114     1.442  1825    1825        Ashe 37009  37009        5  1091     1      10  1364     0      19 MULTIPOLYGON (((-81.47276 3...
# 2 0.061     1.231  1827    1827   Alleghany 37005  37005        3   487     0      10   542     3      12 MULTIPOLYGON (((-81.23989 3...
# 3 0.143     1.630  1828    1828       Surry 37171  37171       86  3188     5     208  3616     6     260 MULTIPOLYGON (((-80.45634 3...
# 4 0.070     2.968  1831    1831   Currituck 37053  37053       27   508     1     123   830     2     145 MULTIPOLYGON (((-76.00897 3...
# 5 0.153     2.206  1832    1832 Northampton 37131  37131       66  1421     9    1066  1606     3    1197 MULTIPOLYGON (((-77.21767 3...
# 6 0.097     1.670  1833    1833    Hertford 37091  37091       46  1452     7     954  1838     5    1237 MULTIPOLYGON (((-76.74506 3...

Как я могу сохранить этот объект печати в списке (который будет используется в функции позже) без вывода на консоль?

Когда я грубо помещаю его в список, не пытаясь подавить вывод, он печатает, как ожидалось: 

a <- lst(dim(nc), head_sf = print(nc, n = getOption("sf_max_print", default = 6)))
# Simple feature collection with 100 features and 14 fields
# geometry type:  MULTIPOLYGON
# dimension:      XY
# bbox:           xmin: -84.32385 ymin: 33.88199 xmax: -75.45698 ymax: 36.58965
# geographic CRS: NAD27
# First 6 features:
#    AREA PERIMETER CNTY_ CNTY_ID        NAME  FIPS FIPSNO CRESS_ID BIR74 SID74 NWBIR74 BIR79 SID79 NWBIR79                       geometry
# 1 0.114     1.442  1825    1825        Ashe 37009  37009        5  1091     1      10  1364     0      19 MULTIPOLYGON (((-81.47276 3...
# 2 0.061     1.231  1827    1827   Alleghany 37005  37005        3   487     0      10   542     3      12 MULTIPOLYGON (((-81.23989 3...
# 3 0.143     1.630  1828    1828       Surry 37171  37171       86  3188     5     208  3616     6     260 MULTIPOLYGON (((-80.45634 3...
# 4 0.070     2.968  1831    1831   Currituck 37053  37053       27   508     1     123   830     2     145 MULTIPOLYGON (((-76.00897 3...
# 5 0.153     2.206  1832    1832 Northampton 37131  37131       66  1421     9    1066  1606     3    1197 MULTIPOLYGON (((-77.21767 3...
# 6 0.097     1.670  1833    1833    Hertford 37091  37091       46  1452     7     954  1838     5    1237 MULTIPOLYGON (((-76.74506 3...

Я подумал invisible или sink подавят вывод, но я не могу понять, ничего из этого не работает: 

a <- invisible(lst(dim(nc), head_sf = print(nc, n = getOption("sf_max_print", default = 6))))
a <- lst(dim(nc), head_sf = invisible(print(nc, n = getOption("sf_max_print", default = 6))))
a <- lst(dim(nc), invisible(head_sf = print(nc, n = getOption("sf_max_print", default = 6))))

Есть предложения? спасибо

РЕДАКТИРОВАТЬ: Использование invisible и capture.output дает в значительной степени то, что я хотел (вывод был неправильным, когда я изначально разместил это - ошибка с моей стороны) 

    a <- lst(dim(nc), invisible(capture.output(head_sf = print(nc, n = getOption("sf_max_print", default = 6)))))
    a
    $`dim(nc)`
[1] 100  15

$`invisible(...)`
 [1] "Simple feature collection with 100 features and 14 fields"                                                                               
 [2] "geometry type:  MULTIPOLYGON"                                                                                                            
 [3] "dimension:      XY"                                                                                                                      
 [4] "bbox:           xmin: -84.32385 ymin: 33.88199 xmax: -75.45698 ymax: 36.58965"                                                           
 [5] "geographic CRS: NAD27"                                                                                                                   
 [6] "First 6 features:"                                                                                                                       
 [7] "   AREA PERIMETER CNTY_ CNTY_ID        NAME  FIPS FIPSNO CRESS_ID BIR74 SID74 NWBIR74 BIR79 SID79 NWBIR79                       geometry"
 [8] "1 0.114     1.442  1825    1825        Ashe 37009  37009        5  1091     1      10  1364     0      19 MULTIPOLYGON (((-81.47276 3..."
 [9] "2 0.061     1.231  1827    1827   Alleghany 37005  37005        3   487     0      10   542     3      12 MULTIPOLYGON (((-81.23989 3..."
[10] "3 0.143     1.630  1828    1828       Surry 37171  37171       86  3188     5     208  3616     6     260 MULTIPOLYGON (((-80.45634 3..."
[11] "4 0.070     2.968  1831    1831   Currituck 37053  37053       27   508     1     123   830     2     145 MULTIPOLYGON (((-76.00897 3..."
[12] "5 0.153     2.206  1832    1832 Northampton 37131  37131       66  1421     9    1066  1606     3    1197 MULTIPOLYGON (((-77.21767 3..."
[13] "6 0.097     1.670  1833    1833    Hertford 37091  37091       46  1452     7     954  1838     5    1237 MULTIPOLYGON (((-76.74506 3..."

1 Ответ

1 голос
/ 17 июля 2020

Вероятно, плохой подход, не зная, какой дальнейшей обработке будут подвергаться возвращаемые значения (я чувствую, что отдельные dims, head_sf нежелательны), и особенно плохо, если вы ненавидите циклы, но использует вариант вашего invisible(capture.output как видно подавить автоматический вывод консоли : 

library(sf)
library(tidyverse)
nc <- st_read(system.file("shape/nc.shp", package = "sf"))
nc1 <- nc
nc2 <- nc
nc3 <- nc
nc_lst <- list(nc1, nc2, nc3)

prepare_sf_head_for_further_process_loop3 <- function(nc_lst) { 
a_quote <- list()
for(i in 1:length(nc_lst)) {
invisible(capture.output(a_quote[[i]] <- list(dims = dim(nc_lst[[i]]), head_sf = print(nc_lst[[i]], n = getOption('sf_max_print', default = 6)))))
}
return(a_quote)
}


>b3 <- prepare_sf_head_for_further_process_loop3(nc_lst)
>b3
[[1]]
[[1]]$dims
[1] 100  15

[[1]]$head_sf
Simple feature collection with 100 features and 14 fields
geometry type:  MULTIPOLYGON
dimension:      XY
bbox:           xmin: -84.32385 ymin: 33.88199 xmax: -75.45698 ymax: 36.58965
geographic CRS: NAD27
First 10 features:
    AREA PERIMETER CNTY_ CNTY_ID        NAME  FIPS FIPSNO CRESS_ID BIR74 SID74
1  0.114     1.442  1825    1825        Ashe 37009  37009        5  1091     1
2  0.061     1.231  1827    1827   Alleghany 37005  37005        3   487     0
3  0.143     1.630  1828    1828       Surry 37171  37171       86  3188     5
4  0.070     2.968  1831    1831   Currituck 37053  37053       27   508     1
5  0.153     2.206  1832    1832 Northampton 37131  37131       66  1421     9
6  0.097     1.670  1833    1833    Hertford 37091  37091       46  1452     7
7  0.062     1.547  1834    1834      Camden 37029  37029       15   286     0
8  0.091     1.284  1835    1835       Gates 37073  37073       37   420     0
9  0.118     1.421  1836    1836      Warren 37185  37185       93   968     4
10 0.124     1.428  1837    1837      Stokes 37169  37169       85  1612     1
   NWBIR74 BIR79 SID79 NWBIR79                       geometry
1       10  1364     0      19 MULTIPOLYGON (((-81.47276 3...
2       10   542     3      12 MULTIPOLYGON (((-81.23989 3...
3      208  3616     6     260 MULTIPOLYGON (((-80.45634 3...
4      123   830     2     145 MULTIPOLYGON (((-76.00897 3...
5     1066  1606     3    1197 MULTIPOLYGON (((-77.21767 3...
6      954  1838     5    1237 MULTIPOLYGON (((-76.74506 3...
7      115   350     2     139 MULTIPOLYGON (((-76.00897 3...
8      254   594     2     371 MULTIPOLYGON (((-76.56251 3...
9      748  1190     2     844 MULTIPOLYGON (((-78.30876 3...
10     160  2038     5     176 MULTIPOLYGON (((-80.02567 3...

>class(nc_lst[[1]]
[1] "sf"         "data.frame"
>class(b3[[1]]$head_sf)
[1] "sf"         "data.frame"

Черт, не знаю, почему getOption ('sf_max_print', default = 6) не ограничивается 6. dplyer имеет контролируемая цитата / аннулирование, но я еще не разработал для этого применения. Это мои плохие предложения. 't get the dim, кажется намного проще, чем мой выше, и предоставляет желаемые значения bbox. И все же не ограничивается 6, потому что метод head для sfg жестко запрограммирован на 10L: 

> getS3method('head', 'sfg')
function (x, n = 10L, ...) 
{
    structure(head(unclass(x), n = n, ...), class = class(x))
}
<bytecode: 0x5646a6a38228>
<environment: namespace:sf>
...