Вы не поставили деталь
/config=Release
внутри вашего цитируемого текста команды.
Ваша команда должна выглядеть примерно так:
"c:\Program Files\NUnit 2.4.8\bin\nunit-console.exe /config=Release C:\projects\IntegrationTests\IntegrationTests.nunit" 2>&1
... я не проверял параметры командной строки nunit-console.exe, но, полагаю, вы уже проверили, работает ли команда nunit.