Включение Windows Длинных путей (Пути длиной более 260 символов) и перезагрузка не сохранит вас здесь.
Если вы видя эту проблему, одно из решений - переместить ваш проект так, чтобы пути, которые он пытается скопировать, не превышали 260 символов. По сути, возьмите свой проект и переместите его как можно ближе к root диска.
Возможно, есть лучшее решение, однако мне не удалось найти способ сообщить об этом Microsoft Publishing Tool правильно интерпретировать пути длиннее 260.