Согласно документации вы можете определить функцию обратного вызова, которая будет вызываться после окончания анимации:
animate (params, [duration], [замедление],
[обратный звонок])
$(".ImageRoller ul").animate(
{'marginLeft' : "-"+ScrollWidth+"px"},
Speed,
'linear',
function() {
alert('animation end');
}
);