Я не знаю, какие методы у меня в голове, но вы должны иметь возможность загрузить файл в DataTable, а затем использовать ADO.net для его передачи в базу данных (посмотрите на класс SqlBulkCopy, если используется база данных SQL Server).
Это должно дать вам достаточно слов, чтобы разобраться и найти хороший пример.