GraphViz - Как подключить подграфы?

Question

На языке DOT для GraphViz я пытаюсь представить диаграмму зависимостей. Мне нужно иметь возможность иметь узлы внутри контейнера и иметь возможность привязывать узлы и / или контейнеры к другим узлам и / или контейнерам.

Я использую subgraph для представления своих контейнеров. Связывание узлов работает просто отлично, но я не могу понять, как соединить подграфы.

Учитывая приведенную ниже программу, мне нужно иметь возможность соединить cluster_1 и cluster_2 стрелкой, но все, что я пробовал, создает новые узлы вместо соединения кластеров:

digraph G {

    graph [fontsize=10 fontname="Verdana"];
    node [shape=record fontsize=10 fontname="Verdana"];

    subgraph cluster_0 {
        node [style=filled];
        "Item 1" "Item 2";
        label = "Container A";
        color=blue;
    }

    subgraph cluster_1 {
        node [style=filled];
        "Item 3" "Item 4";
        label = "Container B";
        color=blue;
    }

    subgraph cluster_2 {
        node [style=filled];
        "Item 5" "Item 6";
        label = "Container C";
        color=blue;
    }

    // Renders fine
    "Item 1" -> "Item 2";
    "Item 2" -> "Item 3";

    // Both of these create new nodes
    cluster_1 -> cluster_2;
    "Container A" -> "Container C";
}

Answer 1

В руководстве пользователя DOT приведен следующий пример графика с кластерами с ребрами между кластерами

digraph G {
  compound=true;
  subgraph cluster0 {
    a -> b;
    a -> c;
    b -> d;
    c -> d;
  }
  subgraph cluster1 {
    e -> g;
    e -> f;
  }
  b -> f [lhead=cluster1];
  d -> e;
  c -> g [ltail=cluster0,lhead=cluster1];
  c -> e [ltail=cluster0];
  d -> h;
}

и ребра между узлами и кластерами.

Answer 2

Для удобства пользования решение, описанное в ответе HighPerformanceMark применительно к исходному вопросу, выглядит следующим образом:

digraph G {

    graph [fontsize=10 fontname="Verdana" compound=true];
    node [shape=record fontsize=10 fontname="Verdana"];

    subgraph cluster_0 {
        node [style=filled];
        "Item 1" "Item 2";
        label = "Container A";
        color=blue;
    }

    subgraph cluster_1 {
        node [style=filled];
        "Item 3" "Item 4";
        label = "Container B";
        color=blue;
    }

    subgraph cluster_2 {
        node [style=filled];
        "Item 5" "Item 6";
        label = "Container C";
        color=blue;
    }

    // Edges between nodes render fine
    "Item 1" -> "Item 2";
    "Item 2" -> "Item 3";

    // Edges that directly connect one cluster to another
    "Item 1" -> "Item 3" [ltail=cluster_0 lhead=cluster_1];
    "Item 1" -> "Item 5" [ltail=cluster_0 lhead=cluster_2];
}

compound=true в декларации graph имеет жизненно важное значение. Это производит вывод:

Обратите внимание, что я изменил ребра на ссылочные узлы в кластере, добавил атрибуты ltail и lhead для каждого ребра, указав имя кластера, и добавил атрибут уровня графа 'component = true'.

Что касается беспокойства о том, что кто-то может захотеть подключить кластер без узлов внутри него, мое решение было всегда добавить узел в каждый кластер, визуализированный с помощью style = plaintext. Используйте этот узел для маркировки кластера (вместо встроенного в кластер атрибута «label», который должен быть установлен в пустую строку (в Python, label='""'). Это означает, что я больше не добавляю ребра, которые соединяют кластеры напрямую , но это работает в моей конкретной ситуации.

Answer 3

Убедитесь, что вы используете fdp макет для файла. Я не думаю, что neato поддерживает кластеры.