<div id="blinkin">My Blinkin' Message</div>
... затем у подножия тела
<script>
setTimeout(function() {
document.getElementById('blinkin').style.color = 'transparent'; // or 'white' for IE as @bobince notes?
}, 600);
setTimeout(function() {
document.getElementById('blinkin').style.color = '';
}, 1600);
</script>
Очевидно, что, как отмечает @ Джастин-Джонсон, использование библиотеки делает это проще.
На самом деле, более "стандартный" способ привлечения внимания к элементу был бы, возможно:
$('blinkin').animate({backgroundColor: '#ffff99'}, 1000).animate({backgroundColor: '#ffffff'}, 2000);
(jQuery, похоже, не имеет эффекта highlight
прототипа, это предположение о том, что это будет.)