Есть некоторые настройки, которые вы можете использовать. Вы определяете эти настройки, редактируя файл config.js в корневом каталоге ckeditor. Например, если вы хотите быть радикальным, как я, вы можете написать:
config.forcePasteAsPlainText = true;
Если вы хотите ограничить только определенные теги в точности так, как вы сказали, я нашел настройку ниже:
config.removeFormatTags = 'b,big,code,del,dfn,em,font,i,ins,kbd';
Последнее будет сделано только тогда, когда пользователь выполнит команду «удалить формат».
Дополнительная информация: http://docs.cksource.com/ckeditor_api/symbols/CKEDITOR.config.html#.format_tags
Учитывая все время, я думаю, что вы уже нашли свой ответ, но другим можно помочь.