Я считаю, что перестройка обычно находит классы (так как это проблема пути к классам). Netbeans, кажется, агрессивно компилирует существующие тесты, но основной исходный код (по крайней мере из настроек maven) не всегда доступен.
Я начал запускать полные сборки, чтобы попытаться решить эту проблему. Возможно, есть плагин, который решает эту проблему, но я еще не нашел его.
РЕДАКТИРОВАТЬ: Это может помочь.