Прежде всего, в Subversion "филиал" == "обычный каталог". Вы создаете «ветви» каталога в репозитории и говорите, что он будет содержать ветви, но Subversion не отличает этот каталог от других. То же самое относится к «стволу», «тегам» и т. Д.
Таким образом, когда вы выполняете «обновление» на ветке, вы обновляете только каталог.
Как сказал Лассе, чтобы получить изменения в стволе, вы должны использовать операцию "слияния".