Насколько я вижу, у вас нет проблем с импортом ваших модулей. Попробуйте, чтобы проверить, готово ли все необходимое для вас. Возможно, это не является причиной вашей проблемы, но лучше тоже проверить это
iPuthon автоматически импортирует системный путь django, поэтому все, что вам нужно, всегда готово.
import sys
sys.path
проверьте это, чтобы увидеть, все ли вам нужно, когда вы запускаете его из Eclipse, FIFF с результатом ipython ...