Я пытаюсь построить 16 различных деревьев суффиксов для проекта секвенирования генов. Они строятся в основном как таковые
int main()
{
ifstream fp;
fp.open("filepath", ifstream::in);
Tree I(fp);
fp.close();
Я пытаюсь использовать их в своем конструкторе с этим кодом:
Tree::Tree(ifstream &fp)
{
string current = "";
char* line;
fp.getLine(line, 100); //ignore first line
for(int i=0; i<100; i++)
{
char temp = (char)fp.get();
if(temp=='\n')i--;
else current+=temp;
}
insert(current);
while(fp.good())
{
current = current.substr(1,99);
char temp = (char)fp.get();
if(temp=='\n')temp=(char)fp.get();
if(temp==EOF) break;
current+=temp;
insert(current);
}
}
Когда я пытаюсь скомпилировать, я получаю эти ошибки для каждого экземпляра, в котором я использую fp:
suffix.cpp: в конструкторе Tree::Tree(std::ifstream&)
:
суффикс.cpp: 12: ошибка: недопустимое использование неопределенного типа struct std::basic_ifstream<char, std::char_traits<char> >
/usr/lib/gcc/x86_64-redhat-linux/4.1.2/../../../../include/c++/4.1.2/iosfwd:89: ошибка: объявление struct std::basic_ifstream<char, std::char_traits<char> >
суффикс.cpp: 15: ошибка: недопустимое использование неопределенного типа struct std::basic_ifstream<char, std::char_traits<char> >
/usr/lib/gcc/x86_64-redhat-linux/4.1.2/../../../../include/c++/4.1.2/iosfwd:89: ошибка: объявление struct std::basic_ifstream<char, std::char_traits<char> >