Полагаю, вы можете выполнить mysqldump для процедур и триггеров, что-то вроде этого:
mysqldump --routines --no-create-info --no-data --no-create-db --skip-opt <database> > outputfile.sql
Затем выполните поиск / замену в верхнем регистре этого файла дампа и затем перезагрузите процедуры / триггеры обратно в вашу БД.