Нет, вы не можете.
Файл конфигурации приложения не играет никакой роли во время компиляции. И именно тогда разрешаются пространства имен.
Боюсь, что нет способа сделать определенное пространство имен доступным "глобально", т.е. без упоминания его в каждом файле.