В этом случае в качестве решения предназначен каталог бизнес-данных.
Решение BDC можно сканировать из коробки.
К сожалению, для BDC требуется лицензия Enterprise для SharePoint, а это очень дорого.
Любое другое решение потребует html-интерфейса с базой данных либо путем включения данных в сами веб-страницы SharePoint, либо в пользовательский набор страниц.
Я не пробовал использовать пользовательский поисковый сервис, поэтому не могу комментировать это.
Достаточно просто включить поиск по обоим источникам контента, так как OOB SharePoint предоставляет возможность различать источники контента и позволяет создавать области поиска, которые позволяют создавать правила на основе типа контента или URL-адреса.