Вы пытались загрузить новый проект CodeIgniter и попытаться загрузить его в среду тестирования? это работает?
В моем эксперименте ошибка 500 обычно связана с проблемой веб-сервера. Но из того, что ты сказал, у тебя не было .htaccess. Лучше просто загрузите чистый CI-проект и посмотрите, нормально ли работает ваш веб-сервер.