Раньше мне приходилось делать это для настройки схем электропитания по умолчанию, так как нужно было дотронуться до каждого компьютера, я обновил скрипт входа в систему, чтобы просмотреть все профили в Documents and Settings и загрузить все файлы ntuser.dat для обновления я использовал язык сценариев WinBatch, он имеет специальные функции для загрузки кустов реестра.
Теперь, так как вы упомянули, что это необходимо сделать для компьютеров без зарегистрированных пользователей, я бы предложил запустить программу с помощью такого инструмента, как Microsoft SMS или Altaris, если он у вас есть. Кроме этого, я думаю, что psexec может быть твоим другом.