Это произойдет, если вы обновите свой рабочий каталог до более ранней версии и начнете вносить изменения оттуда. После фиксации «исправить поврежденную ссылку» вы сделали hg update, который вернул вас к «вторичному обновлению адреса».
Это легко исправить, сначала убедившись, что ваш рабочий каталог находится на кончике, а затем hg merge -r fix_broken_link