Отправитель всегда имеет контроль над тем, какой класс используется при сериализации объекта. Например, Fluorine отправит все, что реализует IList в .NET как ArrayCollection, клиенту Flex или Array - клиенту Flash. В этом случае нет другого выбора, кроме как использовать ArrayCollection или Array.
Другие реализации AMF могут отличаться. Фтор обрабатывает зарегистрированные псевдонимы классов последними, но другие могут сделать это первыми. То, будет ли Vector. <> Правильно сериализован в обоих направлениях, зависит от сервера, который вы используете.
Лучший способ узнать, работает ли он на вашем сервере, - просто протестировать его. Затем, если это не сработает, задайте более конкретный вопрос, чтобы выяснить, есть ли обходной путь или он считается ошибкой.