Поместите значения в массив, выполните обратную сортировку, используя rsort () , а затем возьмите первые два:
$values = array('01-blahbla.php', '02-sdfsdff.php', '03-aaaaaaa.php', '04-bbbbbbb.php', '05-wwwwwwi.php');
rsort($values);
$file1 = $values[0];
$file2 = $values[1];
require_once $file1;
require_once $file2;
В руководстве по PHP на php.net есть отличная информация о различных методах сортировки.
Обновление:
Как отмечает Psytronic, rsort не будет работать с числами, но вы можете создать пользовательскую функцию, которая легко делает то же самое:
function rnatsort(&$values) {
natsort($values);
return array_reverse($values, true);
}
$files = rnatsort($values);