Встроенные стили генерируются из HTML или (чаще в наши дни) JavaScript, применяя стили после загрузки страницы.
Jquery часто является виновником этого, выполняя анимацию, используя CSS, примененный непосредственно к элементу, который переопределяет вашу таблицу стилей.
Например, вы можете показать, а затем скрыть div, оставив 'display: none' в элементе, который перекрывает любой естественный каскадный CSS, предшествующий ему. Это часто встречается, когда вы смешиваете переходы CSS и медиа-запросы с помощью JavaScript.
Проверьте ваш JavaScript на наличие экземпляров примененных стилей.
Попробуйте использовать функцию обратного вызова на анимации для очистки стилей:
$(this).css( "display", "" );