Хотя то, что вы хотите, вероятно, покрыто дубликатом, вы задали один конкретный вопрос, на который нужно ответить:
Мне нужен способ включить скомпилированный * .exe в другую программу
Ты не можешь этого сделать. В лучшем случае вы можете создать библиотеку, как подсказывает @Justin Ethier, на которую полагаются как ваш графический интерфейс, так и инструмент командной строки.